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Etudes de Cas de la Synthèse de Peptide
(Peptide Synthesis Case Studies)

La longue histoire de GenScript dans la synthèse de peptide de qualité supérieure nous a donné l’opportunité d’examiner des problèmes aussi bien communs que rares de la synthèse peptidique et d’en trouver des solutions. Quelquefois, plus d’une solution sont trouvées. Vous trouverez ci-dessous des détails sur trois cas spécifiques illustrant la compétence et l’innovation des méthodes de GenScript mises en œuvre dans la Plate-forme de synthèse de peptide, FlexPeptideTM. Nous avons trouvé des moyens de résoudre les problèmes qui affectent la synthèse des peptides riches en cystéine, des peptides multi phosphorylés, et des peptides extrêmement longs.

  • Etude de Cas Ⅰ
  • Etude de Cas Ⅱ
  • Etude de Cas Ⅲ

1. Peptides Riches en Cystéine

La synthèse des peptides contenant plusieurs ponts disulfures peut être difficile. Cela est dû à la formation éventuelle des multiples ponts disulfures sur n’importe quel peptide assez riche en cystéines. Peu de sociétés dans le monde entier offrent des services de synthèse de peptide riches en cystéine contenant deux ponts disulfures, et aucune d’entre elles n’est capable d’en synthétiser contenant encore plus. Cependant, GenScript a développé deux voies distinctes autour de cet obstacle, rendant ainsi à la fois possible et abordable, la synthèse des peptides contenant plusieurs ponts disulfures.

La première des deux voies consiste en une oxydation par étapes, en utilisant des groupes protecteurs différents pour protéger chaque paire de cystéines au cours d’un processus de synthèse par Fmoc SPPS. Différentes conditions de déprotection sont utilisées à GenScript, pour le clivage de chaque groupe protecteur. Ces conditions sont soigneusement choisies en fonction des besoins spécifiques du projet de chaque client. Grâce aux oxydations ultérieures et par étapes des ponts disulfures pendant la phase liquide, nous pouvons synthétiser, avec une très grande précision, des peptides comportant plus de deux ponts disulfures.

La deuxième méthode fonctionne par le repliement et l’oxydation. Le point clé est de prendre le peptide dans son état de repliement en phase liquide et d’y oxyder toutes les cystéines pour former, en une étape, un peptide contenant des ponts disulfures natifs, et utiliser ensuite la zymohydrolyse pour orienter la position des ponts disulfures.

Etude de Cas : Peptide A
Séquence : H - Cys - Asn - Cys - ... ... ... - Cys - ... ... ... - Cys - ... ... ... - NH2
Pont disulfure : 1 - 11, 3 - 15
Résultats HPLC :


Résultats SM :

2. Peptides Multi-phosphorylés

Il existe deux types de phosphopeptides : les mono-AA-phosphorylés et les multi-AA-phosphorylés. Le groupe des multi-phosphorylés est très difficile à synthétiser, en raison de son acidité élevée et de sa capacité à réduire le taux d’activation au cours de Fmoc SPPS. GenScript a développé deux stratégies pour une synthèse fiable de phosphopeptides.

La première est la synthèse directe par étape de phosphopeptides en phase solide, en utilisant des phospho-amino-acides mono-benzylés et la chimie Fmoc. Cette stratégie entraîne deux problèmes : le couplage de bzl-pAA et le couplage d’AA suivant. Pour les résoudre, GenScript applique la technologie micro-ondes pour coupler le bzl-pAA, laquelle technologie rend la synthèse de phosphopeptides aussi simple que celle des peptides ordinaires.

La deuxième stratégie est une méthode de phosphorylation globale, qui implique la phosphorylation post-synthétique de groupes hydroxyles non protégés sur un support solide. Après la synthèse, tous les groupes phosphorilisables sur un tel peptide peuvent être phosphorylés en une étape en phase liquide. Cette méthode a l'avantage d'éviter les difficultés liées à la synthèse directe de Bzl-AAP.

Etude de Cas : Peptide B
Séquence : Thr- ... ... ... -pTyr- ... ... ... -pTyr-pTyr- ... ... ... -Lys
Résultats HPLC:


Résultats SM :

3. Peptides extrêmement long

Le système FlexPeptideTM emploie la méthode de ligation propriétaire de GenScript pour obtenir des hauts rendements de peptide, même pour peptides très longs. Ceci est accompli, par la synthèse au préalable de plusieurs courtes séquences, jointes entre elles par la suite avec une haute efficacité.

Etude de Cas : Peptide C
Séquence : Ala-Glu...-Lys-....-Lys-Lys-....-Glu-Ala-...-Ala-Ala
Longueur : 149 AA; M.W.: 15971.51
Résultats HPLC :


Résultats SM :